Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Emx2Q04744 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms