Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nf1Q04690 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nf1Q04690 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms