Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOP2BQ02880 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TOP2BQ02880 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOP2BQ02880 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms