Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NfiaQ02780 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfiaQ02780 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfiaQ02780 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms