Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1cQ01815 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cacna1cQ01815 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacna1cQ01815 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms