Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx1P83917 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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