Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad1P70340 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smad1P70340 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smad1P70340 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms