Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capza3P70190 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capza3P70190 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capza3P70190 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Capza3P70190 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capza3P70190 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms