Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb4bP68372 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb4bP68372 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tubb4bP68372 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms