Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms