Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ElobP62869 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ElobP62869 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ElobP62869 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ElobP62869 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ElobP62869 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ElobP62869 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms