Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm5P62322 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm5P62322 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms