Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Copz1P61924 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copz1P61924 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copz1P61924 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copz1P61924 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copz1P61924 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms