Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2nP61089 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2nP61089 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms