Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Strn4P58404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn4P58404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn4P58404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms