Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NcstnP57716 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms