Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn18P56857 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms