Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX9P48436 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX9P48436 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX9P48436 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms