Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax9P47242 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax9P47242 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax9P47242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms