Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Etv1P41164 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms