Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa4P31532 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Saa4P31532 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Saa4P31532 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Saa4P31532 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa4P31532 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Saa4P31532 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa4P31532 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Saa4P31532 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Saa4P31532 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Saa4P31532 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa4P31532 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa4P31532 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Saa4P31532 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Saa4P31532 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Saa4P31532 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Saa4P31532 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Saa4P31532 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms