Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxa2P31245 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms