Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd28P31041 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms