Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atxn10P28658 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atxn10P28658 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atxn10P28658 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms