Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dusp1P28563 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dusp1P28563 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.5 ms