Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd40lgP27548 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms