Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NdnP25233 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NdnP25233 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NdnP25233 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NdnP25233 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NdnP25233 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NdnP25233 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NdnP25233 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NdnP25233 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NdnP25233 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NdnP25233 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NdnP25233 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms