Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria2P23819 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gria2P23819 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria2P23819 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms