Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gria1P23818 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gria1P23818 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gria1P23818 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms