Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP100P23497 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP100P23497 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP100P23497 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP100P23497 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP100P23497 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP100P23497 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP100P23497 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP100P23497 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP100P23497 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SP100P23497 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP100P23497 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP100P23497 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP100P23497 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP100P23497 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP100P23497 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms