Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-D1P14427 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms