Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl2P10889 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl2P10889 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl2P10889 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl2P10889 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms