Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHGAP10645 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHGAP10645 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHGAP10645 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHGAP10645 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHGAP10645 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHGAP10645 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHGAP10645 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHGAP10645 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHGAP10645 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHGAP10645 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHGAP10645 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHGAP10645 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHGAP10645 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHGAP10645 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHGAP10645 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHGAP10645 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHGAP10645 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHGAP10645 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHGAP10645 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHGAP10645 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHGAP10645 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHGAP10645 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHGAP10645 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHGAP10645 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHGAP10645 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHGAP10645 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHGAP10645 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHGAP10645 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHGAP10645 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHGAP10645 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHGAP10645 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms