Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifna9P09235 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms