Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgk2P09041 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgk2P09041 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgk2P09041 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms