Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Ifna5P07349 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms