Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04212 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04212 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04212 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04212 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04212 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04212 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04212 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P04212 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms