Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01853 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01853 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01853 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01853 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01853 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01853 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01853 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01853 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01853 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01853 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01853 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01853 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01853 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01853 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01853 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms