Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01790 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01790 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01790 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01790 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01790 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01790 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01790 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01790 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01790 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01790 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01790 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms