Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFPL2O75678 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL2O75678 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL2O75678 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms