Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtssO70370 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtssO70370 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtssO70370 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtssO70370 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CtssO70370 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtssO70370 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtssO70370 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtssO70370 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtssO70370 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtssO70370 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtssO70370 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtssO70370 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtssO70370 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtssO70370 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtssO70370 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtssO70370 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtssO70370 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtssO70370 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtssO70370 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtssO70370 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtssO70370 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtssO70370 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtssO70370 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtssO70370 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms