Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap1O55125 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap1O55125 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap1O55125 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms