Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Nedd9O35177 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Nedd9O35177 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Nedd9O35177 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Nedd9O35177 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Nedd9O35177 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Nedd9O35177 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd9O35177 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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