Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF646O15015 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF646O15015 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms