Protein–RNA interactions for Protein: O09112

Dusp8, Dual specificity protein phosphatase 8, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp8O09112 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dusp8O09112 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Dusp8O09112 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp8O09112 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms