Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6871L7N248 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6871L7N248 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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