Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ5

Cfap73, Cilia- and flagella-associated protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap73J3QPZ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap73J3QPZ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap73J3QPZ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms