Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C6orf229H3BNL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C6orf229H3BNL8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms