Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm5798F7BTS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm5798F7BTS7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm5798F7BTS7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm5798F7BTS7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm5798F7BTS7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Gm5798F7BTS7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5798F7BTS7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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