Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28048F7BCN0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms